Você pode adicionar o número do pedido ou ordem de compra importado da loja virtual nas informações complementares da nota fiscal.
Para isso, posicione o mouse sobre mouse o ícone da engrenagem 
> Todas as configurações > Notas Fiscais > Configurações de NF-e > Configurações de preenchimento.
Em seguida, ative a opção 'Adicionar número da ordem de compra/pedido loja virtual nas informações complementares da nota fiscal' e salve.
Após ativar e salvar essa configuração, os próximos pedidos importados terão a informação preenchida nas informações complementares da nota fiscal.