Cada produto possui um valor em seu cadastro geral, mas é possível inserir um preço diferente para cada loja virtual.
Para verificar e editar o valor dos produtos na sua loja virtual, acesse o menu Cadastros > Produtos e clique no carrinho de loja virtual 
. Clique em Exibir e verá os campos específicos de cada loja virtual.
Você poderá alterar o valor de cada produto neste campo, ou editar o valor de vários produto de uma loja em massa, por planilha.
Lembrando que, após editar o valor no Bling, tanto manualmente, quanto por planilha, é preciso sincronizar os preços com a loja virtual.
Links úteis
Como importar produtos da loja virtual?
Como sincronizar o preço dos meus produtos com a loja virtual?